Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garem1Q3UFT3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garem1Q3UFT3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms