Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brf2Q3UAW9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms