Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VwceQ3U515 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms