Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hvcn1Q3U2S8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hvcn1Q3U2S8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hvcn1Q3U2S8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hvcn1Q3U2S8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hvcn1Q3U2S8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms