Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kdm4dQ3U2K5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms