Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms