Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q3U1D9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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