Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Palb2Q3U0P1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms