Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hace1Q3U0D9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms