Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fbxw18Q3TSA9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms