Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Fndc4Q3TR08 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Fndc4Q3TR08 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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