Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms