Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TQQ9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms