Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CiartQ3TQ03 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms