Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctdnep1Q3TP92 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctdnep1Q3TP92 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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