Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hp1bp3Q3TEA8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hp1bp3Q3TEA8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms