Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms