Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms