Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap5b1Q3TAP4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap5b1Q3TAP4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms