Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riiad1Q3KNY5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms