Protein–RNA interactions for Protein: Q2EG98

Pkd1l3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l3Q2EG98 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd1l3Q2EG98 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l3Q2EG98 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l3Q2EG98 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l3Q2EG98 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l3Q2EG98 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l3Q2EG98 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms