Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shroom4Q1W617 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
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Shroom4Q1W617 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
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Shroom4Q1W617 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
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Shroom4Q1W617 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
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Shroom4Q1W617 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Shroom4Q1W617 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Shroom4Q1W617 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Shroom4Q1W617 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Shroom4Q1W617 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
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Shroom4Q1W617 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Shroom4Q1W617 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Shroom4Q1W617 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Shroom4Q1W617 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Shroom4Q1W617 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Shroom4Q1W617 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Shroom4Q1W617 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Shroom4Q1W617 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Shroom4Q1W617 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Shroom4Q1W617 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
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