Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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