Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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