Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd300lgQ1ERP8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms