Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Atp8b1Q148W0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Atp8b1Q148W0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Atp8b1Q148W0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Atp8b1Q148W0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Atp8b1Q148W0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Atp8b1Q148W0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Atp8b1Q148W0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms