Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtel1Q0VGM9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms