Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc162pQ0VG85 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms