Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc39dQ0VF76 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Ttc39dQ0VF76 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Ttc39dQ0VF76 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc39dQ0VF76 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms