Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms