Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rundc1Q0VDN7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms