Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms