Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf541Q0GGX2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf541Q0GGX2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms