Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms