Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc4Q08624 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms