Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MestQ07646 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MestQ07646 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MestQ07646 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MestQ07646 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MestQ07646 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MestQ07646 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MestQ07646 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MestQ07646 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MestQ07646 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MestQ07646 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms