Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AmbpQ07456 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms