Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdf3Q07104 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms