Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprgQ05909 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprgQ05909 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms