Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SryQ05738 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SryQ05738 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SryQ05738 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SryQ05738 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SryQ05738 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms