Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rcn1Q05186 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms