Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox8Q04886 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms