Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top1Q04750 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms