Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nf1Q04690 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
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Nf1Q04690 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Nf1Q04690 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nf1Q04690 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nf1Q04690 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nf1Q04690 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nf1Q04690 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Nf1Q04690 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Nf1Q04690 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Nf1Q04690 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Nf1Q04690 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nf1Q04690 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms