Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RelaQ04207 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RelaQ04207 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms