Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kcnd1Q03719 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms