Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddr1Q03146 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddr1Q03146 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms