Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp11Q02853 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms