Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nucb1Q02819 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nucb1Q02819 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms