Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna1sQ02789 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna1sQ02789 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms